La estación de ferrocarril de Caniles (Granada) se inauguró, como el resto del tramo del Almanzora a Baza, en el año 1894, perteneciente a la línea Guadix-Baza-Almendricos. Su ubicación junto a la fábrica azucarera “Nuestra Señora de las Mercedes”, la convirtió en una de las más importantes de este tramo ferroviario en la primera mitad del siglo XX.
Con el cierre de esta línea el 31 de Diciembre de 1984, la estación y los bienes vinculados a ella fueron desmantelándose y sumidos progresivamente en el olvido. Recientemente, la Diputación Provincial y la Unión Europea-Fondos Feder han rehabilitado las instalaciones de la estación y han puesto en marcha en su edificio principal un centro de interpretación de la geodiversidad del Altiplano de Granada. También se ha incluido a la estación de Caniles en el trazado de la vía verde de la comarca de Baza.